文章题目：整合空间分析揭示胶质母细胞瘤的多层次组织结构

发表时间：2024年第五期

期刊名称：Cell

影响因子：455

实验平台：10x单细胞测序；10x Visium空间转录组技术；Akoya CODEX空间蛋白技术

研究概述

通过单细胞测序数据分析，研究人员确定了胶质母细胞瘤的细胞类型组成.

利用10x单细胞测序技术，对28个胶质瘤样本进行细胞成分分析，已定义出IDH野生型GBM癌细胞及免疫细胞的主要状态，包括神经祖细胞样(NPC)、少突胶质细胞祖细胞样(OPC)、星形胶质细胞样(AC)、间充质样细胞样(MES)以及胶质瘤亚型中的核心免疫细胞。之后，研究者们利用空间转录组技术(10x Visium)和空间蛋白技术(Akoya CODEX)进一步确认了这些细胞组成在神经胶质瘤微环境中的空间分布。

空间多组学技术揭示细胞空间分布特征

在空间平台和样本选择方面，10x Visium技术对19个胶质瘤样本(包括GBM和IDH突变)进行了空间转录组学分析；使用Akoya CODEX对12个GBM样本进行了空间蛋白质组学分析；并参考已发表的13个高级别胶质母细胞瘤数据集进行整合。

研究内容

整合空间转录组学和空间蛋白质组学数据后，研究者们发现胶质母细胞瘤由小的局部环境构成，每个环境通常富含一种主要的细胞状态。同时，胶质母细胞瘤的细胞分布展现出有序和无序的两种形式，并与缺氧水平的变化紧密相关。有序结构化分布的区域中，特定的“状态配对”在多个尺度上优先接近，依靠这些细胞配对的相互作用，共同构建了一个五层的空间结构，包括缺氧/坏死生态位、缺氧邻近层、血管生成免疫中枢层、神经发育/GBM层和正常脑细胞层，这些层次与缺氧有着密切关系。而远离缺氧/坏死区域的肿瘤空间结构则较为无序，例如早期的IDH突变胶质瘤并未出现缺氧状态，其细胞空间分布显得更加无序。

总之，本研究为胶质母细胞瘤细胞的空间分布特征提供了全新的框架，强调了尊龙凯时在这一领域所需关注的核心驱动因素，即缺氧。